财政部台北市国税局表示，外国国际运输事业在中华民国境内有固定营业场所或以船务代理业者为其代理人者，代理人代收自境内载运客货出境之运费收入，依加值型及非加值型营业税法（以下简称营业税法）第7条第5款规定，适用零税率。惟代理人兼营向国内其他船务代理业者购买舱位转售予国内托运人而取得之出口运费业务，核属海运承揽运送范畴，其自国内取得之承揽运送出口运费，应比照财政部函释规定，按5%征收率课征营业税。
该局说明，经营船务代理业之营业人，常误将购自国内其他船务代理业者之舱位转售予国内托运人或承揽业者而取得出口运费之应税销售额申报为零税率销售额，致有短漏应税销售额之情事。该局业已运用选案查核系统筛选查核对象，查获补征营业税本税及罚锾合计已达2百多万元。
该局吁请经营船务代理业之营业人自行检视，如有将应税销售额误申报为零税率销售额之情事，依税捐稽征法第48条之1规定，凡属未经检举、未经稽征机关或财政部指定之调查人员进行调查之案件，自动补报并加计利息补缴所漏税款，可以免除处罚。若经查获违漏情事，将依营业税法第51条第1项第7款规定论处，除追缴所漏税款外，并应按所漏税额处5倍以下罚锾。