(一) 在课程设计及师资方面，力求统整与层次化，兼顾学生于心理、咨商之学术研究基础层面，以及理论与实务应用层面的学习。另，明确区分硕士班以咨商实务能力培养为主轴，咨心组形成学校辅导与社区咨商两大核心课程；博士班以从事咨商专业提升为目标，建构咨商师教育与咨商心理学研究两大范畴。复健组的课程则力求兼顾国情与国际专业发展标准，以培养职业重建个案管理、就业服务、职业辅导评量、职业训练及其有关之督导人员为主的课程。在国内尚未建立复健咨商证照制度之际，至少能与国外专业接轨。
(二) 课程规划在维持两组独立之开课系统外，也以“基础先备及统计基础共同选修”型式，以及考量学生因其研究领域与个人兴趣，得以跨组选修某些科目的方式，让学生能够各取两组所长，增加学习的丰富性。