ChIP-seq采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后，

分离与其结合的基因组DNA片段，并通过高通量测序，

在全基因组范围内寻找目的蛋白特异结合的DNA位点，

且可基于多个样品进行差异比较分析及特异蛋白结合位点的序列偏好性分析。

用于在全基因组范围内研究蛋白特异结合的DNA片段，

对基因表达的调控以及染色体的功能结构。

已广泛应用于人、小鼠、酵母、水稻、拟南芥等物种的研究。

每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果。

序，获得高质量reads，通过motif分析判断IP的特异性以及分析的可信性，

高效预测相关基因，进行功能富集分析、

预测特异蛋白的功能，组蛋白染色体结合图谱以及DNA的表观修饰。