疾病管制局九十四年度委托科技研究计划，历经四个月的审查，在137件合格申请计划中，共择优通过61项计划，通过率为44.5％，详细评选结果公布于本局万维网（www.cdc.gov.tw）。
本次通过的计划涵盖整个传染病防治领域之研究，包括有：国内结核病、艾滋病、肝炎、登革热、肠病毒、流感、 SARS等重要传染病之流行病学监测调查、防治策略及效益评估研究；预防生物恐怖攻击及境外移入新兴传染病之研究；疫苗接种效益评估之研究；建置传染病致病原及基因数据库之研究。
本局站在防疫最前线，为全国防疫中枢。面对层出不穷的新兴及再浮现疾病，难免有力有未逮之处。如何结合学术界的力量，突破防疫工作的瓶颈，成为刻不容缓的工作。所谓“知己知彼，百战百胜”，唯有对于疾病了解的更加透澈，才能掌握关键因素或防疫窍门。每年本局将依防疫需求，提出最迫切需解决的问题，透过委外研究或本局科技研究计划，以问题导向的方式进行研析，探究可能解决问题的关键因素；配合防疫需求于适当时间内在本局防疫学术研讨会中提出研究结果；经由学术与防疫专家充分的脑力激荡后取得共识，让研究结果成为研订政策或防疫措施的支持与佐证；并在防疫措施推动一段时间后，进行政策检讨与评估，适时的修正策略，让防疫工作更加切中目标，增进施政绩效。