业务执掌：医疗(事)机构管理、医事人员管理、紧急医疗救护、医疗资源规划、医事品质促进、市立医院管理、配合全民健康保险业务等事项。
业务执掌：护理机构管理、长期照顾服务规划发展与管理、身心障碍医疗鉴定业务、医疗扶助等事项。
业务执掌：健康管理与促进、卫生保健业务、烟害防制之推展、监督、规划、考核、健康促进职场等事项。
业务执掌：法定各项急、慢性传染病之监测通报、医院感染控制及防治宣导、疫苗预防接种及营业卫生、外籍劳工健康检查核备管理等事项。
业务执掌：卫生企划、研究发展、计划管考、法制、为民服务、国际卫生交流合作、区域合作、卫生所管理、公共关系、议事联系、卫生保健志愿服务、社区医学训练、卫生教育与健康行销、资讯基础设施维护管理、资讯安全管理、应用系统维运管理、万维网站维运管理、资讯系统规划建置及软件授权管理、卫生所资讯管理等事项。
业务执掌：组织编制、人员任免、迁调、奖惩、考绩、训练进修、差勤管理、待遇福利、员工协助方案、退休抚恤等人事业务。
业务执掌：预算之编审与执行、决算之审编、会计账务管理执行、统计业务暨月报、年报编报业务等事项。
业务执掌：廉政宣导及社会参与、公职人员财产申报、利益冲突回避及廉政伦理相关业务、机关贪渎与不法事项之处理、风险业务之清查、公务机密维护及机关安全维护之处理。