本署于候讯室走道设置有“检举箱”、“意见箱”，凡民众对于检察业务有兴革意见者，得作成意见书，凡检举犯罪或检举假藉职务刁难者，得作成密封之检举书分别投入“意见箱”、“检举箱”。本署每日定时派员收取办理。
本署检举邮政信箱：马祖南竿邮政第10号信箱。
意见书应记载真实姓名、性别、年龄、籍贯、职业、住居所（或联络电话）及对检察业务兴革之具体意见。
三、检举书应记载事项：
检举人之真实姓名、性别、年龄、国民身份证字号、籍贯、职业及住居所。
被检举人之姓名、职业、住居所或其他足资辨识之特征。
具体事实及证据 ：检举人之姓名，本署绝对保密。因检举有功者，依法奖励；唯如捏造事实诬陷他人者，则依法究办。
四、为民服务意见调查表之使用：
为提高行政效率，为人民做最诚挚有效的服务，本署印有“为民服务意见调查表”置于服务台前，请自行抽取填写，提供宝贵意见，做为本署日后业务兴革、改进之参考。