三合一选举结束，幽灵人口问题仍未平息，据了解，马祖四乡户政事务所正积极进行户籍催迁的工作，目前已锁定全县约1066人，这些人经户警机关多次查察无实际居住事实，因此要严格执行催迁任务。选举过后，相关单位于12月12日召开检讨会议，针对幽灵人口问题进行后续处理方式的讨论，据了解，检方根据连续多月查察的结果，筛选出四乡五岛自去年八月以后迁入马祖的人口，计1066人，这些人确实无所谓的居住事实。最近传出马祖检方提供这份名单，要求户政机关于明年元月底以前，要全部强制将户籍迁出，否则要以渎职罪将四乡的户政事务所主任起诉，但地检署方面否认有强制要求户政事务所的情况。实际上各乡户政机关已经全面在进行此事。
幽灵人口定义问题在社会上还有争议，检方列管的一千多人之中，将户籍迁入马祖不全然是为了投票，而且在此次三合一选举之中，这一千多人确实有前往投票的并不多，因此在迁户籍为了投票这项事证上，更加难以认定。另外，在去年八月以前户籍就在马祖而同样无居住事实的大有人在，如果强制迁户籍只针对所谓的新鲜幽灵人口，在法理的公平性上会有争议。