燕麦麸的副作用可能会出现腹部胀痛或者是消化不良，也可能伴随着腹泻以及腹部疼痛。这些不良副作用通常是因为长时间摄入以后，导致人体蛋白质补充受阻引起，会干扰到正常的胃肠功能，也会干扰到正常吸收。

燕麦麸属于一种高营养的膳食纤维食物，适当摄入的情况下并不会产生一定的副作用，但是长时间摄入或者是过量摄入，会导致其他营养物质的吸收和利用，从而出现了不容易消化迹象也会遗留在胃肠内无法排出，从而导致腹部出现疼痛以及肿胀的，还会伴随着消化不良。如果本身就属于胃炎或者是肠胃蠕动过慢人群，不适合摄入会导致症状出现加重。