测序

单细胞 RNA 测序技术的快速发展使得人们从单个细胞水平定量研究细胞的全基因组转录水平成为可能。如何从高维的单细胞 RNA 测序数据中获取关于细胞和基因组的有用信息是单细胞 RNA 测序数据分析备受关注的重要问题，广大研究者开发了大量的计算方法和软件进行相应的数据分析。本综述论文将总结单细胞 RNA 测序数据分析的一般流程与及数据分析中所需要使用数学基础，主要内容包括对原始数据进行转换、降维、聚类分析、拟时间分析和拷贝数变异分析等，重点介绍相应数据处理方法背后的数学原理，揭示如何利用数学工具在单细胞 RNA 数据获取信息，以便于数学工作者进行单细胞数据分析工作和对现有方法进行深入发展和改进

鸭茅是世界四大禾本科栽培牧草之一，在我国西南地区广泛种植使用，因其抗旱性强、耐贫瘠、耐荫性强以及产量高、草质柔嫩、适口性好、营养价值高等特点，可用于青饲、青贮或调制干草，在边际土地及石漠化深度贫困区草牧业发展中发挥着重要作用。在四川省农作物及畜禽育种攻关计划持续支持下，四川农业大学饲草育种团队潜心钻研，采用三代测序技术结合Hi-C和Bionano辅助组装技术从鸭茅中鉴定到40088个蛋白编码基因，其中1173个基因家族是鸭茅特有基因，并挖掘出4个控制开花性状的潜在调控基因，基因组组装的相关参数较好，是已经公布的白三叶、黑麦草基因组的20- -50倍。研究成果于2019年在植物学权威期刊《Plant Biotechnology Jourmal》 在线发表了题为《Genome assembly provides insights into the genome evolution and flowering regulation of orchardgrass》的研究论文，首次公布了鸭茅的高质量参考基因组，也是我国第一个公布的牧草参考基因组

长链非编码RNA及其与肿瘤发生发展的关系 [PDF] 随着基因测序技术的发展人们发现非编码RNA在机体正常的生命活动及疾病发生、发展中发挥作用其中长链非编码RNA(lncRNA)在非编码RNA中较晚引起人们重视是目前研究的热点。lncRNA在机体中的功能多样且复杂在转录水平、转录后水平以及表观遗传水平上均能调节基因的表达参与基因组修饰、转录激活、转录干扰、染色体沉淀等过程并在多种疾病(包括肿瘤)的发生、发展中起重要作用。研究lncRNA内在机制能帮助人们更加深入地了解肿瘤有望作为肿瘤诊断和预后的分子标志物应用于临床并能够为临床治疗肿瘤提供新的靶点

有人在知乎上问：请教一下现在DNA比对需要多久时间？以前看过一篇文章说CSI剧情不合理，DNA比对需要几天时间，但是今天重庆警方击毙了周克华，晚上就公布了DNA比对的结果。现在做比对到底需要多少时间？ 我是这么回答的。生物信息的同志们可以去补充更多

11月8日，阿联酋科学家、临床医生和政要出席了迪拜因美纳解决方案中心开业典礼。这一全新的前沿设施中心将扩展基因组学能力，构建本地基因组学专业知识体系，以推动并向患者大规模提供精准医疗。 因美纳首席商业官Susan Tousi表示：“我们在阿联酋建立解决方案中心是因为我们看到了巨大的机会，能够进一步加深我们与阿联酋卫生和技术部门以及该地区科学和医疗专业人员的牢固关系

本文摘要：由中国自律研发的新一代基因测序仪在长春月亮相。这意味着中国将挣脱同类产品几乎倚赖进口的局面。 这款新一代基因测序仪是由中国科学院北京基因组研究所和吉林中科紫鑫科技有限公司合作研发

陈婷博士，北京生命科学研究所（NIBS）研究员，博士生导师。2007 年毕业于美国弗吉尼亚大学细胞与发育学专业，后曾就职于洛克菲勒大学（Rockefeller University ）Elaine Fuchs实验室，从事以皮肤干细胞激活与自我更新机制的研究。目前已在Nature、Cell Stem Cell Nature Cell Biology PNAS eLife 等杂志发表文章

宫知远教授主要以转基因技术构建了多种人类疾病的斑马鱼模型、用于药物筛选的转基因肿瘤斑马鱼模型、生物监测环境毒素转基因鱼、生物反应器转基因鱼、转基因荧光观赏鱼等。宫教授以斑马鱼为模型对肝脏发育和肝癌形成的分子机制进行了深入系统的研究，成功地构建出斑马鱼肝癌模型，并研究了与人的肿瘤的相似性及癌症发生的分子机制。近年来以转基因斑马鱼为模型在研究人类肝癌发生的分子机制、肝脏发育等方面取得了一系列重要成果

Othram是一家专注法医学的基因组公司，总部位于德克萨斯州，于2018年成立，目前运营着一家法医DNA测序实验室，专门从事可降解或低输入源材料的基因组序列重建工作。作为人道主义工作的一部分，Othram目前专注于应用其技术来识别遗体。 2019年3月，公司宣布完成400万美元A轮融资，由Nimble Ventures主要投资

科学家最近发现了一种潜在的新的植物沟通形式——寄生性植物菟丝子会与宿主植物交换大量的mRNA。 菟丝子能利用其特殊器官吸根从宿主中获取水与养分。吸根会穿透宿主组织并建立联系，这些联系能让该寄生植物不仅能从其宿主那里吸入水与营养物质，而且还能吸取mRNA和蛋白质这样的大分子，甚至病菌