immunoprecipitation
ChIP-seq(染色质免疫共沉淀测序)根据是否甲醛铰链可以分成N-ChIP(native chromatin immunoprecipitation)和X-ChIP(crosslinking chromatin immunoprecipitation)。之后为了增加peak的分辨率,对ChIP的富集DNA片段进行酶切后建库衍生出了ChIP-exo(exonuclease digestion)。ChIP-seq实验流程包括染色质打算(酶法,超声法),抗体富集,纯化,建库测序
染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA 相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP 与二代测序技术相结合的ChIP-Seq 技术,能够检测全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。 ChIP-Seq 的原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA 片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序
MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing),即甲基化DNA 免疫共沉淀测序。先用5′-甲基胞嘧啶抗体富集胞嘧啶甲基化的基因组片断,然后对富集的片段进行高通量测序。该方法检测范围覆盖全基因组,所需测序数据量较少,但不能在单碱基分辨率水平上检测DNA胞嘧啶甲基化状态
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation Co-IP)是利用抗原和抗体的特异性结合以及细菌的ProteinA或G特异性地结合到免疫球蛋白的Fc片段的现象开发出来的方法。其基本原理是,为了研究细胞中蛋白A与蛋白B是否结合,在细胞裂解液中加入抗蛋白A的抗体,孵育后再加入与抗体特异结合的结合于Agarose珠上的ProteinA或G,若细胞中有与蛋白A结合的蛋白B,就可以形成这样一种复合物:“蛋白B-蛋白A-抗蛋白A抗体-agarose Protein A或G”,经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,复合物又被分开。然后经免疫印迹或质谱检测蛋白B
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation Co-IP)是利用抗原和抗体的特异性结合以及细菌的ProteinA或G特异性地结合到免疫球蛋白的Fc片段的现象开发出来的方法。其基本原理是,为了研究细胞中蛋白A与蛋白B是否结合,在细胞裂解液中加入抗蛋白A的抗体,孵育后再加入与抗体特异结合的结合于Agarose珠上的ProteinA或G,若细胞中有与蛋白A结合的蛋白B,就可以形成这样一种复合物:“蛋白B-蛋白A-抗蛋白A抗体-agarose Protein A或G”,经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,复合物又被分开。然后经免疫印迹或质谱检测蛋白B
GST-pull-down蛋白-蛋白之间的相互作用是蛋白质结构与功能研究中的一个重要方向。GST-P··· 免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation,Co-IP)技术是以抗体和抗原之间的作用为··· 分子生物学技术在微生物和生态学研究中具有灵敏度和精确度高,和快速的优势。但是不能提供微生物的生态学、··· 多色荧光原位杂交 (M-FISH) 是用于精确评估分析复杂染色体重排的技术
