免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation Co-IP）是利用抗原和抗体的特异性结合以及细菌的ProteinA或G特异性地结合到免疫球蛋白的Fc片段的现象开发出来的方法。其基本原理是，为了研究细胞中蛋白A与蛋白B是否结合，在细胞裂解液中加入抗蛋白A的抗体，孵育后再加入与抗体特异结合的结合于Agarose珠上的ProteinA或G，若细胞中有与蛋白A结合的蛋白B，就可以形成这样一种复合物：“蛋白B-蛋白A-抗蛋白A抗体-agarose Protein A或G”，经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳，复合物又被分开。然后经免疫印迹或质谱检测蛋白B。