methylated
medip-seqmethylated dna immuno
MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing),即甲基化DNA 免疫共沉淀测序。先用5′-甲基胞嘧啶抗体富集胞嘧啶甲基化的基因组片断,然后对富集的片段进行高通量测序。该方法检测范围覆盖全基因组,所需测序数据量较少,但不能在单碱基分辨率水平上检测DNA胞嘧啶甲基化状态
展示的比对率是指唯一比对上的 reads 数占总 reads
展示的比对率是指唯一比对上的 reads 数占总 reads 数的 比例,是测序获得的有效数据。MspI 酶切效率即唯一比对 的 reads 中含酶切位点 reads 所占比例。通过软件比对, 进行甲基化位点分析,获得样本中可靠的甲基化位点信息