碱基配对

核酸内切酶IV（E.coli）是一种II类脱嘌呤/脱嘧啶酶，能通过水解作用切断5’端和AP位点之间的连接，形成3’羟基和5’端脱氧核糖-5’-磷酸盐。Endo IV可用于体内DNA游离基的修复。 T4核酸内切酶VII是一种DNA连接特异性核酸内切酶（也称作解离酶或水解酶）

PCR技术（Polymerasechainreaction，PCR）是聚合酶链式反应的英文简称。 它是分子生物学中应用最为广泛的实验方法之一。 它由DNA重组、RNA的合成和蛋白质的体外重组等3个部分组成， 其中最重要的是PCR-DNA重组和PCR-蛋白质合成两部分

模板DNA(待扩增DNA)、引物、4种脱氧核苷酸(dNTPs)、DNA聚合酶和适宜的缓冲液。类似于DNA的自然复制过程，其特异性依靠于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。 PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成： ①模板DNA的高温变性：模板DNA经加热至93℃左右一定时间后，使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离，使之成为单链，以便它与引物结合，为下轮反应作预备； ②模板DNA与引物的低温退火(复性)：模板DNA经加热变性成单链后，温度降至55℃左右，引物与模板DNA单链的互补序列配对结合； ③引物的适温延伸：DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下，以dNTP为反应原料，靶序列为模板，按碱基配对与半保存复制原理，合成一条新的与模板DNA 链互补的半保存复制链重复循环变性-退火-延伸三过程，就可获得更多的“半保存复制链”，而且这种新链又可成为下次循环的模板

②脱氧核糖和磷酸交替连接，排列在外侧，构成基本骨架；碱基排列在内侧。 ③两条链上的碱基通过氢键连接成碱基对，例如： （1）相对稳定性：DNA分子中磷酸和脱氧核糖交替连接方式不变；两条链间碱基互补配对方式不变。 （2）多样性：不同的DNA分子中脱氧核苷酸数目不同，排列顺序多种多样

PCR技术（Polymerasechainreaction，PCR）是聚合酶链式反应的英文简称。 它是分子生物学中应用最为广泛的实验方法之一。 它由DNA重组、RNA的合成和蛋白质的体外重组等3个部分组成， 其中最重要的是PCR-DNA重组和PCR-蛋白质合成两部分

本分类主要指应用于Northern blot实验的缓冲液，如MOPS、SSC、DENHARDTS溶液等。 分子杂交（molecularhybridization）是确定单链核酸碱基序列的技术。其基本原理是待测单链核酸与已知序列的单链核酸（叫做探针）间通过碱基配对形成可检出的双螺旋片段

碱基对是形成核酸DNA、RNA单体以及编码遗传信息的化学结构。组成碱基对的碱基包括腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、鸟嘌呤（G）、胞嘧啶（C）、尿嘧啶（U）。在DNA或某些双链RNA分子结构中，由于碱基之间的氢键具有固定的数目和DNA两条链之间的距离保持不变，使碱基配对遵循一定的规律，腺嘌呤一定与胸腺嘧啶或者在RNA中的尿嘧啶配对，鸟嘌呤与胞嘧啶配对

②脱氧核糖和磷酸交替连接，排列在外侧，构成基本骨架；碱基排列在内侧。 ③两条链上的碱基通过氢键连接成碱基对，例如： （1）相对稳定性：DNA分子中磷酸和脱氧核糖交替连接方式不变；两条链间碱基互补配对方式不变。 （2）多样性：不同的DNA分子中脱氧核苷酸数目不同，排列顺序多种多样

核碱基（英语：Nucleobase）是指一类含氮碱基（nitrogenous base），在生物学上通常简单地称之碱基（base）。是在DNA和RNA中，起配对作用的部分。核碱基都是杂环化合物，其氮原子位于环上或取代氨基上，其中一部分（取代氨基，以及嘌呤环的1位氮、嘧啶环的3位氮）直接参与碱基配对

论文简介： miRNA(microRNA)是一种通过与mRNA靶位点进行碱基配对从而抑制和调控mRNA表达的非编码RNAmiRNA的mRNA靶位点预测一直是miRNA研究领域的一个重要研究方向. 本文模型:栈式去躁自编码器. 本文相较以前使用深度学习进行位点预测的研究在特征维度上进行了扩充及细化如加入了序列组成等具体特征扩充了计算位点保守性和可达性时的上下游区域同时也在模型中输入了原始数据在人工测定的特征基础上让神经网络从原始数据中学习相关特征. 同时在最后的特征重要性比较中也可以看出序列组成原始数据等扩充和添加的特征对于模型的预测有着很大的影响. 本文使用了目前在深度学习解决基因序列问题中常用的自编码模型的结构和思想因此本次论文研读也会对自编码及其相关的内容做一个简单的介绍.