功能域
针对桂桑优12品种进行了转录组测序本文主要分析得到的基因P450 94A1的cDNA序列。通过对桂桑优12与川桑、桃树、梅树、樱桃、毛果杨、橡胶树、甜橙、葡萄、核桃等9种物种的同源序列进行生物信息学分析结果表明测序DNA序列中存在目前P450基因家族公认的同源性保守序列即功能域——包括P450蛋白的ExxR结构域、FxxGxRxCxG结构及DT组成的疏水区功能并对其蛋白质的三维结构图进行了预测。 [3]邱星辉冷欣夫.昆虫细胞色素P450基因的表达与调控及P450介导抗性的分了机制[J].农药学学报1999(1):7-14. [5]艾均文.家蚕(bombyx mori)全基因组细胞色素P450基因结构与进化分析及CYP18A1克隆与功能研究[D].重庆:西南大学2008:1-144.
摘要:该研究利用c DNA末端快速扩增(RACE)技术从雷公藤悬浮细胞中克隆得到一条GGPPS全长c DNA(Gene Bank:KM978333)并对其进行多重序列比对、蛋白结构预测及构建系统进化树等生物信息学分析。所克隆的Tw GGPPS c DNA全长1 857 bp编码含514个氨基酸的蛋白序列相对分子质量为57.13 k Da等电点为7.85具有5个保守域和2个功能域亚细胞定位预测显示其可能位于质膜上多重序列比对及系统进化树结果显示与其他植物GGPPS家族具有较高同源性。实验首次克隆了雷公藤GGPPS基因为进一步研究雷公藤甲素等二萜化合物生物合成途径奠定基础
针对桂桑优12品种进行了转录组测序本文主要分析得到的基因P450 94A1的cDNA序列。通过对桂桑优12与川桑、桃树、梅树、樱桃、毛果杨、橡胶树、甜橙、葡萄、核桃等9种物种的同源序列进行生物信息学分析结果表明测序DNA序列中存在目前P450基因家族公认的同源性保守序列即功能域——包括P450蛋白的ExxR结构域、FxxGxRxCxG结构及DT组成的疏水区功能并对其蛋白质的三维结构图进行了预测。 [3]邱星辉冷欣夫.昆虫细胞色素P450基因的表达与调控及P450介导抗性的分了机制[J].农药学学报1999(1):7-14. [5]艾均文.家蚕(bombyx mori)全基因组细胞色素P450基因结构与进化分析及CYP18A1克隆与功能研究[D].重庆:西南大学2008:1-144.