台湾文化学系硕士在职专班，以中、小学教师与公职人员之进修为主，并提供地方文史工作者和有志于地方研究之社会人士进修管道。

本所重点，为强调台湾学与区域研究的结合，从学科内涵提升进修者的专业教学素养与研究能力；以及着重田野调查工作与文献材料解读的搭配能力，朝向东台湾实证研究重镇之路发展；并借由数位资讯运用能力的强化，培养本土文化推广及跨领域研究的人才。

硕士在职专班课程同硕士班，强调以研究生为本位的课程设计。除“学术论文写作与口头报告”、“区域研究法”、“论文研究”等必修课程外，20学分的选修课程部分，研究生可依其论文研究方向，选修其他专业选修课程，与╱或客制化的“台湾文化专题”、“区域研究专题”，以及外系6学分的课程。课程设计理念，为同领域研究所中，少数以研究生论文主题方向为本位的规划。