“人文社会科学研究中心”是中央研究院在人文社会科学领域唯一的研究中心，其设立之目的是希望从事单一学门的研究所无法进行的跨领域研究。现任研究中心主任为萧高彦特聘研究员，副主任为张卿卿特聘研究员及赖孚权研究员。
本研究中心目前包含五个专题中心，分别为“政治思想研究专题中心”、“制度与行为研究专题中心”、“亚太区域研究专题中心”、“调查研究专题中心”，以及“地理资讯科学研究专题中心”。每一个专题中心设一位首席执行官，统筹研究相关事宜。
本研究中心之特色，乃是跨领域研究。例如“制度与行为研究专题中心”以经济学方法为基础，结合法律、资讯及地理等专业，共同探讨网络经济、实证法学及空间竞争等跨领域议题；“亚太区域研究专题中心”的研究计划涵盖了跨界与流动、海洋史、发展与人口等领域；“政治思想研究专题中心”则结合政治、历史、法学、哲学等相关领域，从事比较政治思想之研究。
除了学术研究，本中心也提供广泛的学术服务。“调查研究专题中心”为全国最专业之调查研究机构，同时接受学术单位的委托，进行各种面访及电访调查，并建置学术调查数据库予学界使用。“地理资讯科学研究专题中心”的发展宗旨为透过空间资讯科学与技术，促进人文学与社会科学的跨领域整合研究；此外，也提供各种地理资讯技术给历史、考古及社会学学者，并因应民事需要提供空照资料给一般民众。