虽然有研究提示慢性疲劳综合征患者的血清学、免疫学、病毒学等实验室检查、影像学检查、心理测查存在着异常，但目前还没有任何一项被纳入慢性疲劳综合征的诊断指标。进行实验室检查的目的是排除其他引起疲劳的已知疾病，而不是作为确诊慢性疲劳综合征的依据。

肝功能、肾功能、血糖、电解质、乙肝二对半、甲状腺功能检查，以排除 易于发生疲劳的常见疾病，如乙肝、甲状腺功能异常。

１．头部磁共振　观察脑部有无病变，能明确是否存在脑结构改变。

２．脑电图与脑电功率谱分析　评估慢性疲劳综合征脑疲劳程度。

３．表面肌电图　评估慢性疲劳综合征的肌肉疲劳程度。

４．睡眠呼吸监测　排除睡眠呼吸暂停综合征。

５．评价工具（量表）　评价抑郁或焦虑等状态，治疗效果评价。