近年来，学院广泛与国外高校建立友好的合作关系，在引进国外优势教育资源，推动我院学科建设、联合培养学生及提升我校科研实力等方面取得了丰硕的成果。2012年，我院与俄罗斯新西伯利亚大学在上合大学框架下签署双边合作协议，可互派生态学方向研究生进行学习交流，为期6-12个月；2014年，我院与俄罗斯人民友谊大学签署合作协议，学生毕业后可获得双方学校的学位；2015年，我院与英国曼彻斯特大学签署院际协议，完成课程对接，目前该大学仅优先接收我院自费留学生。

国际研究合作与交流亦日益频繁和深入，分别与日本京都大学、北海道大学、俄罗斯科学院远东分院生物与土壤科学研究所、美国加州大学戴维斯分校、康涅狄格大学等国际著名大学在环境科学、环境工程及生态学领域的优势学科领域进行了实质性的项目合作研究。