“澎湖县税捐稽征所”成立于民国35年（1946）3月，受省府财政厅指挥监督及县府财政科指导，掌理税捐稽征业务，同年12月扩编为澎湖县税捐稽征处。民国38年（1949）因为澎湖地理环境特殊，工商业发展缓慢，税源有限，将税捐稽征处撤销，业务并入县府财政科。民国52年（1963）7月1日，又设立新制的澎湖县税捐稽征处，办公处暂时设在中华路，民国54年（1965）4月14日才在治平路17-1号兴建办公厅舍。民国68年（1979）又在对面兴建二层楼办公室一栋，77年（1988）再增建为三楼。民国81年（1992）9月1日起，原来由税捐处代征的国税业务移拨给新成立的国税局澎湖分局；目前的业务包括土地增值税、地价税、房屋税、契税、使用牌照税、娱乐税、印花税等7个税目之地方税的稽征（洪文源、叶茂生2005：88-90、444）。