重庆市中药研究院市科委直属、财政全额拨款的公益一类副厅局级科研事业单位，其主要职能：一是开展中药学科理论研究、交流与合作；二是进行中药资源开发及新药研究；三是培养中药学科人才、推进中药生产技术进步。主要承担国家、省部级中药科研项目和企业委托科技项目。全院现有在职职工236人，离退休职工217人，在职员工中科技人员占职工总数的63%。具有研究生以上学历51人；高级职称41人，中级职称66人；享受国家政府津贴专家7人；省级学术技术带头人6人，后备学术技术带头人1人；国家药典委员会委员2名，国家新药评审专家6名，国家保健食品评审专家3名；10名专家成为兼职博士或硕士生导师；10余人成为国家科技奖励评审专家和国家项目评审专家。先后聘请3名院士、10余名全国知名专家为客座研究人员。研究院在市科技特派员管理系统中注册有53人。