1、制定我区各种急性传染病、慢性非传染性疾病防治方案，指导各医疗单位和有关单位贯彻执行；
2、建立健全的疫情报告网，作好疾病流行的预测、预报工作；
3、指导、参与疫区的现场调查和处理工作；
4、负责疾病监测工作，分析疾病流行趋势，掌握流行规律，为制订防治计划提供依据；
5、拟定性病、艾滋病的预防控制规划和措施，开展预防控制工作；
6、负责性病、艾滋病的疫情分析及预测预报；参与性病、艾滋病重大爆发疫情的紧急处置和控制。
7、对我区危害群众的主要流行性疾病开展调查，研究其流行因素和规律，提出针对性的防制措施；
8、掌握各医疗单位的消毒、隔离和院内交叉感染情况，指导其控制措施的落实，做好全县医疗机构、托幼机构的消毒效果监测。
计划免疫方面：
1、根据上级提出的预防接种策略，结合我区实际情况，制订免疫规划，安排工作计划；
2、健全管理制度，组织免疫实施，对疫苗、接种器材、冷链设备和免疫实施过程加强管理；
3、确保疫苗的稳定性和抗原量，对疫苗在运输、储存、使用过程中冷藏、冷运，定期效价监测，保证疫苗的质量；
4、负责基层计划免疫专业人员进行培训制，制订技术管理标准，使计划免疫工作规范化和标准化；
5、通过新闻媒介和各种宣传工具，广泛开展计划免疫宣传；
6、加强疫情报告，做到及时、准确，掌握相应疾病的发病率、疫情漏报率，尽可能对每一病例进行流行病学个案调查，分析疫情动态及分布，控制暴发流行；
7、开展人群免疫水平、免疫成功率监测工作；进行免疫接种后异常反应调查与处理，定期检查，正确评价工作质量，寻找薄弱环节，修订工作计划。
8、做好药品、疫苗等物资管理，定期盘存，做到帐物相符；