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从新生儿出生开始，通过比如分娩、喂养、甚至呼吸等渐进和缓慢的方式获得自己的肠道菌群。新生儿的肠道菌群与免疫系统是如何发育并相互影响的，这是一个有趣而又有很多未知存在的领域。2016年5月5日的Cell上有两篇文章对此进行了进一步的研究