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过去10年因为水产养殖业发展速度快，对环境造成破坏，造成农作物生产能力下降。为增加水产生物对疾病的抵抗力及饲料效益，在水产养殖中添加益生菌的研究应运而生，1986年开始第一例将益生菌应用在水生生物(水中的生物体)的研究，之后益生菌被应用在改善水质及控制细菌性的传染疾病。现在已有足够的证据可以证明益生菌可以提高对营养物质的消化率、降低紧迫等