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微生物菌种保藏中心是国家级药用微生物菌种保藏管理的专门机构之一，1979年加入国际菌种保藏组织，成为中国微生物菌种保藏管理委员抗生素菌种保藏中心，缩写名为CCSIIA。中心承担着抗生素工业生产菌种的收集、鉴定、评价、保藏、供应、培训与国际交流等任务。截止2010年，中心所保藏的各类微生物菌种数已经超过了20000株，资源来源遍及全国各地，收藏的菌种类别主要有细菌、放线菌、酵母菌和丝状真菌，具备的生物活性主要有：抗真菌、抗病毒、抗耐药菌、抗结核、抗肿瘤、免疫抑制和活性酶抑制等