特异性检测羟甲基化： 5-hmC抗体能够区分甲基化和羟甲基化信号，特异性的检测羟甲基化区域。
灵活度高：能够直接对任意物种的高羟甲基化片段进行测序，无需已知的基因组序列信息。
检测范围广：覆盖整个基因组范围的羟甲基化区域。
精确度高：能够在实际结合位点50个碱基范围内精确定位。
数字化信号：直接对羟甲基化片段进行测序和定量，不存在传统芯片杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题。
研究证实TET家族蛋白可以催化5mC转化为5hmC。5mC已经被广泛研究，但对5hmC的分布和功能知道的还很少。利用hMeDIP-seq测序技术对小鼠胚胎干细胞的wild-type和Tet1-depleted type的5hmC进行研究。
5hmC在转录活性高的基因的gene bodies区域和受到Polycomb抑制的发育调节因子的启动子区域；5hmC可能在基因表达调控中起着激活和抑制的双重功能。