针对某媒体批评中央补助高雄市登革热防治经费，疾管署说明如下：该署本(108)年初即核定稍多于去年之861万元，补助高雄市政府卫生局办理登革热防治。有关高雄市于5月21日行政院重要蚊媒传染病防治联系会议提案，另请求登革热防治所需经费4635万元，在高雄市已着手办理动支第二预备金程序后，如仍确有需求，疾管署本于中央地方共同合作防疫，亦会循往例进行审查，给予必要之补助。
另卫福部自103年至107年连续5年皆有动支第二预备金补助地方政府办理登革热防治工作，监察院及立法院预算中心曾分别于106年11月及107年8月就连续多年以同事由动支二备金情形进行调查及要求说明。
疾管署表示，中央订有登革热防治工作指引，疾管署设有各区管制中心，协助各县市进行各项防治工作。目前病例集中在高雄市三民区，强化病例群聚区块防治作为及密集向民众宣导，落实防疫工作，是为首要之务。此外，亦吁请邻近县市应加强警戒，积极预防病媒传染病之发生。
疾管署再次呼吁，防疫不分中央地方，登革热防治工作需中央、地方及全民一起合作，才能有效对抗登革热。