本系为化工系与材料系跨领域整合之学系，符合台湾重点产业需求，发展方向如下：
课程将赋予学生奈米与分子的视野和知识，使能完全参与现代与未来高科技工程实务。奈米科技与分子工程领域的课程有助于学生在特用化学品、奈米材料与精密化学品之研发与制造。
目前国内的资讯半导体工业及光电工业已成为国内重要产业，由于科学园区和科技工业区的设立，可预期国内的光电及半导体工业需要大量的化工及材料科技人才。因此本系规划材料技术，其重点在奈米材料、光电材料、半导体材料及电子特用化学品之制造与应用。
近年来，科学研究在基础基因工程与微生物学的快速发展下，连带使得“生物技术”成为下一世代另一个耀眼的产业。而生物科技与生化工程所包含的范围，从医学技术、医药保健、食品营养、农业生产、污染防治甚至能源工业等，广泛涵盖了人类生活的多数领域。生化工程之基本制程为化工基础课程，因此本系培养学生具备生化领域之化工应用能力，使能提升国内生物技术的水准，为国内新兴产业提供优秀的生化科技人才。
本系旨在培育学生同时具备“化学工程”与“材料工程”的学识专长，理论与应用能力兼备，同时培育学生具有宽广的通识涵养、开阔的胸襟、关怀人文的素养与研究创新的能力。在必修课程方面，学生将接受完整的化工与材料整合课程的训练，具备化工与材料方面之基本核心学识。选修课程部分，一方面提供化工与材料各相关领域如：奈米、生技、光电、电子、半导体、能源等基础课程，使学生具备基础学识，毕业后有充足的本职学能，吸收新知，并有能力应用甚至开创新兴的科技；另一方面，也提供现今各高科技领域之专业课程。本系亦设计并建立专属化工与材料整合的实验室与实验课程，如：材料化学实验、化工材料实验等，期能训练学生了解理论兼具实务，能动脑亦能动手，成为手脑并用具备研发创意能力的高科技人才。
进修管道：
本系积极地充实大学部之各项实验设备，已在最短时间内设有新颖完善的教学实验室，能够培育学生具备坚强的实验研究能力。2007年本系成立硕士班，2011年硕士在职专班开始招生，并将积极申请成立博士班，届时不仅能培育优秀的高科技工程人才，亦可培育优秀的高科技研发人才。随着学系的成长与硕士班的设立，将逐年增聘拥有化工与材料方面之坚强师资阵容。本系虽为新成立系所，但可预见本系将成为科技研发的重镇，也是培育高科技人才的摇篮。
大学部136学分，硕士班24学分(含硕士论文，须通过学位考试)，硕士在职专班24学分（须通过学位考试）。
连续5年获教育部、经济部补助“产业人才扎根计划”，提供学生国内外实习机会。
本系专兼任师资皆具博士学位。专认师资专长包括：光电材料、奈米材料、高分子材料、生医材料及钢铁材料等。兼任师资大都为中钢公司，具多年实务经验之博士主管，配合执行经济部产学合作计划。