根据中央建设创新型国家的总体战略目标和国家中长期科技发展规划纲要，结合科技布局调整的要求，围绕深圳市实施创新型城市战略，2006年2月，深圳市人民政府及香港中文大学友好协商，在深圳市共同建立中国科学院深圳先进技术研究院，实行理事会管理，探索体制机制创新。

中国科学院深圳先进技术研究院实行理事会制度，由中科院和深圳市政府各委派3人组成，实行双组长制，其主要职责是确定年度建设计划。

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先进材料科学与工程研究所（以下简称“材料所”）于2018年11月14日在深圳市会展中心揭牌，2019年1月1日开始筹建，并于2020年11月11日正式去筹建设。材料所以电子材料为学科特色方向，聚焦电子封装材料、功能材料、光电材料及晶体材料等领域的前沿研究及规模量产成套工艺开发，依托基础科学突破和核心技术优势，不遗余力地推进研究成果的产业化。同时， 注重材料与IT、BT的交叉融合，推动材料学科的全面发展。