本市养殖面积3938公顷(39.38平方公里)占高雄市总面积1.34%。依据106年渔业统计年报，养殖渔业产量3万1051公吨、产值38亿9670万元，其产量大宗之前三项养殖鱼种为虱目鱼、石斑及鲈鱼，而产值大宗之前三项养殖鱼种为石斑、虱目鱼及白虾。各养殖鱼种主要产地，石斑鱼为永安及弥陀；虱目鱼为湖内、路竹、永安及茄萣；白虾为湖内及美浓；鲈鱼为永安、弥陀及湖内；吴郭鱼为湖内、美浓及茄萣。
为加强本市养殖生产环境及发展需要，提高水产品品质卫生及产业秩序化发展，本市划设4处养殖渔业生产区，包括弥陀养殖渔业生产区面积137公顷，永安养殖渔业生产区面积500公顷、永华养殖渔业生产区面积400公顷及新港养殖渔业生产区面积300公顷；及1处弥陀养殖鱼塭集中区面积70公顷，合计1407公顷。
为能改善本市养殖渔业进排水设施，确保养殖产业发展，本局陆续办理养殖渔业生产区鱼塭土沟及土堤道路改善工程、养殖区排水路清淤工作。另配合中央农委会渔业署，为供应永安、永华及新港养殖渔业生产区优质海水，兴建共同给水设施，引中油天然厂LNG冷排水，供鱼塭养殖利用，以嘉惠地方养殖渔民。截至目前为止已分别完成供水渠道(箱涵)1969米及3247.8米，总工程结算金额3亿2160万余元。