中国科技论文在线优秀期刊一等奖（教育部科技发展中心颁发）（2018年、2017年、2016年）
中国高校优秀科技期刊奖（中国高校科技期刊研究会颁发）（2018年、2016年）
中国高校特色科技期刊奖（教育部科技司颁发）（2014年、2012年、2010年）
全国高校科技期刊优秀编辑质量奖（中国高校自然科学学报研究会颁发）（2009年）
北方优秀期刊奖（北方10省市新闻出版局联合颁发）（2007年）
北京市优秀期刊奖（北京市委宣传部、北京市人事局、北京市新闻出版局联合颁发）（2006年）
“专家论坛”栏目获北京市新闻出版局报刊出版引导资金资助项目二等奖（2014年）、中国高校技术类期刊优秀栏目奖（2015年）
第四届、第三届、第二届中国高校科技期刊优秀网站（2017年、2015年、2013年）
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