外传总统蔡英文对公教、政务人员年改法法案三读通过的结果不满，犹如被立院党团打一巴掌；主导年改的政务委员、年改会副召集人林万亿今（4）日接受Hit Fm联播网《蔻蔻早餐》专访时澄清，蔡英文仅说“不要和年改会版本相差太远”，并未对其结果震怒，反而满意改革成功，后续将与各部会协商，研拟施行细则。
6月27日率先三读《公务人员退休资遣抚恤法》，18％优存2年后归零，所得替代率首年将从现行约本俸两倍的90%，砍至本俸两倍的75%，再依每年递减1.5%的幅度，10年后降至60%；现职人员退休金采计基准则延长为15年的平均俸额，退休金起支年龄延至65岁，并设有3万2160元的楼地板数额。
年改三法在立院三读通过的结果，其中，18%优惠存款2年归零，以及所得替代率10年调降，与年改会的决议不同。外界质疑召开一年多的年改会挫败，俨然“玩假的”。而且外传府方不满立院党团与年改会不同调，身兼立院司法法制委员会召集委员的立委段宜康更在脸书开炮，立院审理法案居然遭到干涉，府方企图施压立院党团。
对此，林万亿说，虽然年改会的年改法案版本和最终通过的版本不尽相同，但更能反映民意，而蔡英文仅说“不要和年改会版本相差太远”，并没有外传不满其结果，而且年改会召开以来，让人民更了解年金制度与法令，有其效益，他也全程参与审理法案的过程，告知立委数字变化与法律之间的影响。
至于下一波年改轮到劳工与军人，林万亿说，劳保、军保都要等到立院下个会期才能讨论，由于劳保2007年已经调整，设计一套较完整的提拨制度，修改幅度应该不大；而军保由国防部及退辅会提出，处理现役及退役军人的退伍金，他强调，军保不会回到恩给制，也不会改为提拨制，并与公教人员一样，设有楼地板数额3万2160元。
林万亿说，推动年改就是要拿掉让社会分裂的引信，以后就比较不会讨论哪种职业的退休者“谁领得多”、“国家养的米虫”等污名。