根据日本政府规定，每一个日本国民和在日本居住3个月以上的外国人，都要加入国民健康保险，交一定数额的保险费，领取国民健康保险证。持有国民健康保险证者因生病或受伤而接受治疗时，交30％医疗费即可，剩下的70％由医院和居民所在的地方政府结算。但特殊情况如：单人病房的“差额床费”、假牙治疗、高额的特殊治疗药品、分娩、人工堕胎等等，必须全额由自己负担。

日本入国管理局公布新规，规定从2010年4月1日起，"国民健康保险证"的提交将被作为在留资格变更及更新的必要条件，即被赋予义务化。因此，加入国民健康保险是很重要的。

准备好以下文件，就可以向居住地区的市役所、区役所的国民健康保险课提出加入申请。

如果有同行的家属，也必须一同加入。

申请当日无须缴纳保险金，所以不必准备。日后“国民健康保险被保险者证”会寄到家里。

以东京都23区为例，没有缴纳住民税（都民税及区民税）的人是１个月3325日圆(2010年度)。年收入在一定金额以下的人，保险费还可以减免70％至50％。

国民健康保险的加入时间是以到达日本当日开始计算的，即使是过了一段时间才至市区所、区役所加入的话，也必须补缴之前所积欠的费用。

到日本当地后尽快申请国民健康保险。 晚加入国民健康保险时还是需要缴付入境后至加入后之间费用。

搬家时需在14日以内到新住址所属的区役所、市役所办理新的国民健康保险证。 办理时提出旧的国民健康保险证。没有这个手续的话，就不能享受国民健康保险待遇。

日本学生支援机构（JASSO）实施的外国人留学生医疗费补助制度已于2008年度结束。

许多学校为留学生设有学生保险制度，多是义务加入。内容依学校不同而有差异，须向各校负责留学生事务的窗口询问。