肥胖与糖尿病关系密切，这里所指的糖尿病是II型糖尿病。一般的观点认为当肥胖到一定程度时，出现外周组织（主要是肌肉和脂肪）对胰岛素不敏感，即胰岛素拮抗现象。胰岛就代偿性地分泌更多的胰岛素来对抗这种对胰岛素的拮抗，出现高胰岛素血症。大约数年至数十年后，过度工作的胰岛出现衰竭，发展成为糖尿病。当然肥胖到糖尿病进程的内在机制并不十分清楚（这也是本版主近年主要感兴趣的研究课题，我设想如果条件允许我将在此研究领域工作一生），但如果能够深入地了解到肥胖到糖尿病的进程，必将能找到延缓或阻断这一进程的方法，为糖尿病的I级预防提供帮助。当然患糖尿病之后，减肥是治疗糖尿病的基础。
肥胖病人更容易患癌症。女性肥胖病人患乳腺癌、子宫癌和宫颈癌的危险性增加了3倍，患子宫内膜癌的危险性增加了7倍。男性肥胖病人患结肠癌和前列腺癌的危险性也明显增加。
大部分肥胖病人有脂代谢紊乱，出现高胆固醇血症，高甘油三酯血症等。高胆固醇血症的原因包括遗传和饮食的作用，一般情况下，减肥治疗可使血脂恢复正常。
肥胖病人寿命短，从总的人群来看，在标准体重之外每增加1公斤体重，平均寿命将缩短1个月。肥胖病人容易患心脏意外和中风，近30%的肥胖病人患有胆结石，肥胖病人也容易患退行性骨关节病变、睡眠呼吸暂停综合征等。