眷村博物馆的前身是新竹市调查局，后来转为新竹市环保局使用，之后因为环保局迁移至焚化厂行政大楼，因此馆舍闲置下来，在1997年全国文艺季“竹篱笆内的春天”活动，展示了新竹市的眷村文化，于是在市长的推动，设定计划原预定于空军一村第八区，因土地权属问题无法解决，改将环保局之旧建筑，设为眷村博物馆使用，在2002年12月28日正式开馆，原本展示空间只有一楼，后因文物增加，故扩建二、三楼。
于新竹火车站出口左侧的新竹客运总站搭12路公车于北门国小下即达。
由中山高下新竹交流道→沿光复路向西往南寮方向直行→上东大路高架桥后于“北大路出口”下→沿东大路直行至武陵路向左回转→经水田街后20米即达。（在彰化银行对面）
目前博物馆室内空间约300坪，室外广场约200坪，可供艺文活动使用，入口大门以眷村红门白线的传统造形设计，还有一个很特别的“飞机副油箱水塔”，这个副油箱水塔原是F100战斗机报废的副油箱，后来被眷村居民改装成储水水塔，由新竹三厂眷村捐赠给博物馆，象征了眷村克勤克俭的美德，更代表了眷村博物馆的开馆精神。
馆内一楼为烽火重生─战乱移民潮，介绍眷村历史，二楼规划“缩影中国-竹篱笆内的春天”，为眷村生活情境区，三楼主题为“有情有义-患难与共”为新竹市眷村改建的过程与目前现有状况，也可办理眷村相关文化特展，而研习教室可供各界办理市内活动。眷村博物馆的成立不只是提供民众一个休假的好去处，更可以借由这些历史文物的呈现，让民众可以了解当时的时空背景与文化，富含教育意义。