天主教圣马尔定医院影像医学部成立于公元2005 年，并引进最先进的影像医学诊断技术和聘请高度专业并获得国内专业认可的同仁来提供全面性的影像技术及客制化的诊断服务给临床医师和病人。
本部工作主要有三个单位，包括放射诊断科、核子医学科、放射肿瘤科，致力于对病患以影像医学学方法来诊断及治疗疾病，并期望对未来的病患以研究和教学的方式应用，来促进其影像医学诊断技术和临床治疗方式。此外，参与跨专科跨院校的转诊相关研究，以促进影像医学诊断和基础部学的紧密连结，提供卓越的教学给未来的健康照护者和年轻世代对影像医学有兴趣的研究者。日后持续发展，提供极佳的影像医学诊断及疾病筛检工作，并借由与临床医师之多专科团队合作沟通，达成最高品质的疾病诊疗。
医学影像是指为了医疗或医学研究，对人体或人体某部分，以非侵入方式取得内部组织影像的技术与处理过程，圣马尔定影像医学部由放射诊断科、核子医学科及放射肿瘤科三科组成，目的为民众提供更为完善精准的服务。
团队在具体数据呈现部分，2015 年每月平均检查量如下：放诊科门诊、急诊及住院患者，使用X 光检查量达10317件次、电脑断层CT 检查量1357 件次、磁振造影检查MRI 检查量376 件次，核医造影检查200 件次，正子造影捡查25 件次，放肿科400 治疗人次。团队亦在影像医学部建立日常监控管理指标，在云嘉南地区从诊断到介入，建立完整的流程，有效防止病安事件发生，实际绩效值得鼓励。