紫云寺位于高雄市鸟松区澄清湖畔，1960年由开山住持演禅长老尼购地草创，长老尼为天台宗高僧斌宗上人弟子，因此将紫云寺冠上“南天台”的宗派，名为“南天台紫云寺”，第二任住持为净圆法师。2001年，演禅长老尼有鉴于自身及净圆法师年事皆已高，为使法务永续、正法弘扬，故力邀法鼓山承接紫云寺的法务工作。
法鼓山自接续法务后，历经两年余的建设与努力，于2003年3月1日举行新建大楼启用暨佛像开光祈福法会、新旧任住持暨管理人交接典礼，前任住持净圆法师移交印信，由圣严法师担任第三任住持，期许将紫云寺发展为南台湾心灵环保重镇，发挥净化人心、净化社会的功能，引导社会大众一起建设人间净土。
净圆法师并依止圣严法师为弟子，法名为果净。 紫云寺定期举办：经典共修、念佛共修、菩萨戒诵戒会、禅坐共修等；初级禅训班、禅一、大悲忏法会、各项节庆法会；佛学讲座、成长课程、营队等，致力推广法鼓山理念，期能接引更多大众亲近佛法。