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液相色谱仪分析中，选择流动相时应考虑流动相与填料的作用、纯度、与检测器的匹配、粘度、对样品的溶解度和样品回收等方面。 低交联度的离子交换树脂和排阻色谱填料有时遇到某些有机相会溶胀或收缩，从而改变色谱柱填床的性质。 碱性流动相不能用于硅胶柱系统

利用标准样品对未知化合物定性是较常用的高效液相色谱定性方法。 由于每一种化合物在特定的色谱条件下（流动相组成、色谱柱和柱温等相同），其保留值具有特征性，因此，可以利用保留值进行定性。如果在相同的色谱条件下，被测化合物与标准样品的保留值一致，可以初步认为被测化合物与标准样品相同