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福建省立医院消化内科专业系福建省科技厅和卫生计生委的医学优先发展重点学科，1997年由省政府批准成立福建省胃肠病研究所，1998年由卫生部批准成立临床药理基地，是福建医科大学及福建中医药大学研究生培养点。现有专业人员16名，其中高级职称9名，具有硕士、博士学位者占80%以上，研究生导师6名，另有退休主任医师参加门诊、病房医疗工作。近年来发表论文300余篇，获省科技进步奖或省医药卫生科技进步奖20多项