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摘 要： 内源性非蛋白质编码小RNA (small non-protein-coding RNA 12～24 nt)广泛存在于高等和低等生物体内，通过对靶标mRNA直接切除或抑制其翻译在转录后水平对基因表达起调节作用。已知的小RNA主要分为两大类：一类是微小RNA (microRNA miRNA)，另一类是小干扰RNA (small interfering RNA siRNA).生物信息学方法是小RNA研究的一个重要组成部分。大量的计算方法、相关软件和小RNA数据不断产生，主要介绍内源性非编码小RNA的计算识别与靶基因预测，以模式作物水稻为例介绍了小RNA进化与选择方面的研究进展，并介绍了相关小RNA数据库的基本信息