为推动台湾史学术研究，并增进社会大众对台湾史内涵之了解，自2012年起针对购藏“军机处录副奏折微卷”，推动微卷内容数字化及目录着录编校作业。

清代的行政档案的正本，由于年代久远，流散迁播，不少毁损或遗失，即使现存数量庞大的朱批奏折，亦不齐全。往往使用这些档案研究时，经常会有“多而不全”的缺憾。军机档录副奏折是一套经过副本或汇抄存查的档案，相对较有系统和严整的脉络。台史博希望透过微卷资料转档、档件辑录、目录着录、比对编校、整理建置成研究数据库，可以更有效地推广一手行政档案的研究运用，持续深化台湾历史研究的内容。