北京理工大学是2014年获批的教育部“985二期”国家哲学社会科学创新研究基地“国防科技管理与国防动员研究中心”，通过“985二期”、“211二期”支持，重点建设科技评价与创新管理、科技战略与科技政策、国际科技合作资源监测、军民高技术监测、战略性新兴产业创新管理等研究方向。刘云教授是该创新基地的学术带头人，2004年创建并负责科技评价与创新管理研究中心，2011年，参与组织创建北京理工大学-美国佐治亚理工大学-英国曼彻斯特大学技术创新联合实验室。自2004年以来，专项经费对科技评价与创新管理研究中心以及国际联合实验室的投入累计达1200万元，建成具有国内一流、国际水平、面向国家军民科技战略和创新管理的研究与决策支持平台。2012年，在科技部、发改委、教育部、联合国教科文组织(UNESCO)支持下，刘云教授组织申请获批并担任UNESCO“应对气候变化南南科技合作”教席主持人，拓展气候变化领域南南科技合作与技术转移研究领域，建立“应对气候变化南南科技合作信息平台”，为联合国、中国政府推进南南科技合作提供战略、管理与政策支持。中心有教授5人、副教授10人、讲师6人、博士后5人、博士生26人、硕士生50多人。近五年，中心承担各类国家级科研项目60多项，累计研究经费2000多万元。该中心与联合国系统组织、美、日、欧科学基金组织以及多所国际知名大学保持密切的合作关系，与清华、北大、中科院科技政策所、科技部战略院、国务院发展研究中心等长期合作，为科技部、国家自然科学基金委、教育部、工业与信息化部、发改委、国资委、国家知识产权局、国防科技工业局等部门的科技战略与政策提供支撑。