置主任委员一名,副主任委员三名,主任秘书一名。目前置委员20人,包含行政院政务委员、行政院秘书长、财政部部长、经济部部长、交通部部长、劳动部部长、行政院农业委员会主任委员、卫生福利部部长、行政院环境保护署署长、文化部部长、科技部部长、金融监督管理委员会主任委员、原住民族委员会主任委员、客家委员会主任委员、行政院主计总处主计长、中央银行总裁、内政部部长、教育部部长、行政院公共工程委员会主任委员。
国发会组织下设有综合规划处、经济发展处、社会发展处、产业发展处、人力发展处、国土区域离岛发展处、管制考核处、资讯管理处、法制协调中心、秘书室、人事室、政风室、主计室以及国会及新闻联络中心、中兴新村活化专案办公室2任务编组,另设有1所属机关国家发展委员会档案管理局。