和很多废水处理工艺不一样的是，利用光伏废水处理方式能够减少二次污染。它们使好氧池形成高容积负荷、低污泥负荷的运行状态，从根本上减少剩余污泥的产生。
这是因为利用这项工艺能够提高反应池污泥浓度，有利于高浓度有机物的充分降解。同时还能高效地进行固液分离，大幅提高活性污泥浓度和反应池容积负荷，减少水力停留时间，减少池容需求，并可省去二沉池，且出水水质更好，从而节省占地面积及土建投资。
关于这一点，主要是因为采用光伏废水处理方式可大幅提高好氧池容积负荷，减少占地面积；改造后原有混凝土构筑物全部得到利用，仅新增钢结构设备1 座，能够最大限度地利用了原有设施、设备，节省了投资。