《病毒学报》主要刊登人与动物病毒、植物病毒、昆虫病毒、噬菌体、类病毒、朊病毒以及新病毒等的基础理论研究和应用研究的具有创新性的新成果与新进展。《病毒学报》重点报道国家以及省市（自治区）基金资助的具有原创且首发的论著、研究快报（短篇论著）、评述、综述、简讯以及专题信息动态等，论文审定通过后网络首发，优先在线数字出版。
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