作为一所医疗专业的教育机构，北医大拥有六所附属医院：北医附设医院、万芳医院、双和医院、台北癌症中心、台北神经医学中心及新国民医院，一校六院所组成的TMU HEALTH SYSTEM，总床数超过四千床，是为台北都会地区发展最快速的医疗体系。六家附属医院在见、实习训练上，提供学生完整的设备与空间，以**的临床经验与多元的执业机会，使北医大毕业生就业率超过九成。

北医大一校六院目前拥有四千七百位工作同仁，分别担任教学、行政与医疗工作等，未来随着大北医体系的成长，北医大的人力需求将大幅提升，包括医师、理人员等，在十年内大北医体系将有两千五百四十个人力的职缺，是北医大毕业生就业的保证。