在台湾，医疗产业深受健保制度的影响，截至2012年资料发现，健保自1995年施行后，区域医院与地区医院总家数骤降，从787家减少至502家，健保特约率也率退37.29%，然而同时间医院的总病床是却是逐年成长，产生小型医院日渐消失但大规模医院却人满为患的现象，使资源分配不均问题更佳恶化。2002年7月起医院施行总额制度，大多县市的医院退出市场率皆较总额施行前高，加上健保给付所导致“同工不同酬”问题与民众对于高科技医疗服务的需求增加等因素，使小型医院不利生存，为产业带来巨大冲击与结构性转变，因此对于了解影响中小型医院退出市场的因素是当务之急。
2017年有篇研究探讨中小型医院退出市场之因素，了解总额制度施行前后，影响医院退出市场原因是否有不同。该篇研究采用健保数据库，探讨1998年至2012年与健保署特约之区域医院与地区医院，其在总额制度施行前(1998-2002)与总额制度施行后(2003-2012)的经营情况，并以Cox比例危险模型分析。
医院总额制度施行后，地区医院退出率有上升现象，从12.6%增加至28.2%，其中200家退出的地区医院当中，又以非公立医院占多数，共193家(97%)(见图一、表一)。
研究结果发现，支付制度对于中小型医院存活影响主要有以下几个。首先，总额制度限制医疗市场规模成长，使的医院最小有效规模之优势消逝，过去研究亦指出当整体产业扩张趋缓，厂商退出比例会提高。其次，在总额施行后，市场竞争相关的因素为影响医院存活之重要因子，如门诊规模贺芬达指数、门诊/住院诊次成长率等，这也显示在总额制度下碍于同工不同酬之现象，不利于小型医院竞争有限预算，因而造成小型医院存活率低的问题；最后，该研究发现非公立的地区医院退出市场现象最为显著，可能与该类型医院市场中并无适当的服务定位有关，导致不易存活在竞争市场中。
整体而言，总额制度的施行限制台湾地区整体医疗产业的成长空间，甚至出现结构上的转变，并且扩大医疗院所两极化的发展，进而影响到地区民众医疗照护的可近性，未来应持续关注此现象对于国民健康之影响。