前身为体育组，早在日治时期之帝国大学即有体育部，1945年国民政府来台后改为体育组，经组织法的变革，一直隶属于训导处 (现已改为学务处)，1995年10月24日因大学法修正实施，更名为“体育室”，改隶共同教育委员会，又于2007年学校组织规程修订，将体育室隶属于本中心。下设“体育教学组”、“体育活动组”、“场地设备组”及“法医校区体育组”，负责推展体育教学与研究、体育活动、场地设备管理及其他体育事项，旨在提升体育教学、研究与活动之品质，活化运动场馆之经营与管理，提供优质的体育场馆及设施，并促进教职员工生体能发展，以及增进运动知能与养成运动习惯，追求全人健康。