研究所硕士班成立的目的是为了培养学术研究人才。课程规划是以厚植生物医学或生态暨生物多样性的基本知识，提升专门领域的知识深度，及训练研究与相关工作能力为目标。在课程规划中我们提供多元的生命科学课程以强化学生之专业素养，并落实自然环境保育及基础医学的研究能量。
除了专业知识的教导外，我们透过专题讨论课程的修习使的学生在口语表达能力上能够清晰明白，此外，有鉴于英语在学术沟通与交流为必要的语言工具，本系硕士班研究生的专题讨论皆鼓励以英语演讲、报告使学生习惯以英语表达自己，而达到国际交流的水准。
研究所硕士班的课程安排将使学生具备生命科学教学及研究之能力或胜任生物相关产业工作之能力，透过专题讨论课程的修习将使学生具备沟通及国际交流之能力，整体课程之规划将使学生具备专业伦理及团队合作之精神，综合上述，硕士班之课程安排皆符合本系之教育宗旨与目标。