目前圣马尔定医院的规模为拥有37个医疗专科,急、慢性及长期照护服务超过一千床的区域级教学医院。分为三个院区:
大雅院区-主要提供急、重症医疗及一般诊疗。
民权院区-主要作为精神科门诊及日间照顾。
芳安院区-为本院附设护理之家,另设失智症老人日间照护中心及到宅沐浴车教育训练基地─沐浴福祉教室。
为关怀偏远地区医疗,设有全国唯一全年无休24小时驻村的阿里山医疗站、嘉义县番路乡圣光诊所;
为关怀银发族,在嘉义县、市近20个据点,设有社区型老人日间照顾中心─长青活力站,并开办全国第一部 “失能老人到宅沐浴车”、第一部加热干燥车、全国第二家失智症团体家屋─圣母家屋等;
为促进社区民众健康,致力社区健康营造,定期办理义诊及整合性健康筛检、健康卫生讲座、社区安全评估、 独居老人健康管理、保健天使招募与培训、社区驻点健康小站、健康家庭会员照护以及推广各项健康促进活动等。
为提升医疗水准与确保病人安全,本院鼓励院内学术研究,并积极与政府卫生单位、邻近的大学及医学中心签定合作关系, 提升教学与研究品质。2009年进一步成立医疗品质管理中心,推动医疗品质改善活动,同时开设相关课程, 训练全院各单位以更符合科学的方法执行改善方案。
本院对于医疗服务品质不断精益求精,连续通过医院评鉴最高等级。并持续推动各项品质认证, 全院通过ISO 9001国际品质验证,亦连续获癌症诊疗品质认证、健康检查品质认证、 ISO15189实验室认证、ISO27001资讯安全认证、HACCP食品安全认证、高龄友善照护机构认证、 WHO健康促进医院国际网络会员认证、全球无烟医院网络无烟医院国际金奖。