飞机抵达台南航空站，因本市无公共运输在机场设站，仅能搭乘计程车或亲友开车接送，出站后左转接台一线﹙往台南方向﹚，再接大同路一段，绕过东门圆环续接北门路一段，左转民族路再右转中山路即可到达本署，全程约四公里。
于台南车站下车，左转中山路即可到达本署。
走国道3号者，经国道8号衔接国道1号。
走国道1号者，可于新市交流道下高速公路衔接台一线，经盐行、六甲顶左转接中华路直行，再右转接永康市中山南路前行，续接台南市开元路并过开元陆桥接北门路迄火车站圆环转中山路即到本署。或于大湾交流道下高速公路后右转复兴路，续接小东路直行，再左转北门路二段直行至火车站圆环转中山路即到本署。
走国道3号者，经关庙交流道下高速公路，往市区方向。
走国道1号者于仁德交流下高速公路，往市区方向。
以上均经东门路直行至东门圆环，右转接北门路一段直行再左转接民族路再右转接中山路即可。
有国光客运、统联客运、和欣客运皆可到达台南市，并于公园路兵配厂统一下车，可招呼计程车到本署，若要步行，则自公园路直行接成功路左转，续行约 700 米即可到火车站圆环，循圆环右转中山路即可到本署。
(一)可自行驾车前往，路线图可参阅上述方法。
(二)搭乘台南市公车，凡行经火车站者，均可抵达南站或北站，出站后向右步行至中山路即可到达本署。
现台南市公车共有高雄客运、兴南客运、府城客运联合营运。